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时间:2019-12-16 15:27:21 作者:admin 热度:99℃

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浮萍为世界上最小的单子叶开花植物,它生活于水体中,具有适应性强,分布广,淀粉含量丰富等特点,是一种优良的生物能源植物,同时可以高效吸收富营养和重金属污染水体中的氮、磷及铜、砷等元素,是一种有应用前景的生物清洁植物。2014年由美国能源部资助的第一版浮萍基因组为浮萍功能基因组学和分子生物学研究提供了强有力的参考序列,并且开启了工业化应用的大门。但是第一版基因组是基于二代短读长测序,拼装出了16,055个短片段并导致11.8%的序列缺失。随着测序技术和生物信息学的快速发展,该研究重新利用三代PacBio单分子长读长的测序优势,拼装出的序列连续性比上一版基因组提升了44倍,填补了上一版95.4%的序列丢失区域,鉴定到了更多的完整LTR序列和嵌套LTR区间,为浮萍的生物学研究提供了更优质的参考基因组。

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